Б.1.В.ОД.2 Молекулярная биология
Вопросы для подготовки к зачету по дисциплине
Б.1.В.ОД.2 Молекулярная биология
- Строение и функции нуклеиновых кислот. Молекула первожизни – РНК.
- Полимеразная цепная реакция (ПЦР): компоненты, схема.
- Виды ПЦР: протяженная, мультиплексная, ОТ-ПЦР, ПЦР в режиме реального времени, ПЦР-ПДРФ. Недостатки метода. Применение.
- Секвенирование ДНК с помощью метода А. Максама – У. Гилберта.
- Дидезоксинуклеотидный метод Ф. Сэнгера. Определение нуклеотидной последовательности РНК.
- Геномы клеточных органелл: хлоропласты и митохондрии.
- Биоинформатика. Геномика и метаболономика (базы данных, геном человека, перспективы).
- Репликация ДНК. Топологические перестройки в ДНК. Использование ингибиторов топоизомераз в медицине.
- Проблема недорепликации концевых районов хромосом. Структура и функции теломер. Удлинение теломер с помощью теломеразы. Длина теломерной ДНК и активность теломеразы в клетках человека.
- Теломеразы: структура и механизм действия. Альтернативные механизмы удлинения теломер. Теломерная теория старения. Роль теломеразы в онкогенезе.
- Система рестрикции – модификации у бактерий: открытие, R-M-системы I, II и III типов. Эндонуклеаза EcoRI. Применение. Функции R-M-системы.
- Метилирование ДНК эукариот.
- Репарация ДНК.
- Регуляция транскрипции в промоторах и терминаторах у прокариот. lac-оперон – пример негативной регуляции. Trp-оперон – пример позитивной регуляции.
- Регуляция транскрипции у эукариот. Транскрипционные факторы. Роль структуры хроматина в транскрипции. Альтернативный сплайсинг.
- Уровни организации белковой молекулы. Факторы, определяющие пространственную структуру белка. Постулат Анфинсена. Парадокс Левинталя.
- Модели сворачивания белков. Модель промежуточных состояний. Сворачивание по принципу «все или ничего».
- Механизмы регуляции фолдинга. регуляция скорости превращения «расплавленной глобулы» в нативную структуру; защита частично свернутого белка от неспецифической агрегации. Фолдазы и шапероны. Нарушения фолдинга белков.
- Сортировка белков в клетке. Синтез на мембраносвязанных и свободных рибосомах. Механизмы транспорта белков через мембраны.
- Общие принципы импорта белков в органеллы. Роль транспортеров и шаперонов в транслокации белков через мембрану. Образование коротких пептидов.
- Процессы в гранулярной эпс. Этапы гликозилирования. Особенности предшественников митохондриальных и хлоропластных белков.
- Процессы в комплексе Гольджи. Сортировка белков. Заболевания, связанные с нарушением сигналов внутриклеточного транспорта. Сортировка и транспорт белков митохондрий и ядер.
- Роль катаболизма в обновлении белков в клетке. Стадии деградации белков. Протеолитические ферменты. Лизосомы.
- Механизм действия и функции убиквитина. Структура протеосомы.
- Комплексы циклинзависимых киназ. "Сверочные точки" клеточного цикла. Механизм остановки цикла и перехода к апоптозу. Белок р53: функциональная роль, структура, обмен.
- "Апоптоз изнутри". "Апоптоз по команде". Морфология апоптоза и некроза.
- Факторы апоптоза. Апоптоз в растительных клетках. Патологические состояния, связанные с активацией или угнетением апоптоза. Онкогенез. Протоонкогены и опухолевые супрессоры.
Рекомендуемая литература по дисциплине
Б.1.В.ОД.2 Молекулярная биология
а) основная литература
- Биохимия [Текст] : учебник / В. П. Комов, В. Н. Шведова. - 3-е изд., стер. - М. : Дрофа, 2008. - 639 с. ; 24 см. - (Высшее образование: Современный учебник). - Предм. указ.: с. 620-630. - ISBN 978-5-358-04872-0. (50 экз.).
- Биохимия [Электронный ресурс] : учеб. для академ. бакалавриата : для студ. вузов, обуч. по направл. 655500 "Биотехнология" / В. П. Комов. - 4-е изд., испр. и доп. - ЭВК. - М. : Юрайт, 2014. - 640 с. - (Бакалавр. Академический курс). - Режим доступа: ЭЧЗ "Библиотех". - Неогранич. доступ. - ISBN 978-5-9916-3929-3.
- Молекулярная биология: биосинтез и функционирование макромолекул у прокариот [Текст] : учеб. пособие / В. И. Чемерилова, О. А. Секерина ; рец.: Б. Н. Огарков, С. Н. Жданова ; Иркутский гос. ун-т. - Иркутск : Изд-во ИГУ, 2013. - 314 с. : ил. ; 20 см. - ISBN 978-5-9624-0928-3. (59 экз.).
- Молекулярная биология: биосинтез и функционирование макромолекул у прокариот [Электронный ресурс] : учеб. пособие / В. И. Чемерилова. - ЭВК. - Иркутск : Изд-во ИГУ, 2013. - Режим доступа: ЭЧЗ "Библиотех". - Неогранич. доступ. - ISBN 978-5-9624-0928-3.
б) дополнительная литература
- Молекулярно-генетические и биохимические методы в современной биологии растений [Текст] : научное издание / ред.: Вл. В. Кузнецов, В. В. Кузнецов, Г. А. Романов. - М. : Бином. Лаборатория знаний, 2012. - 487 с. : ил. ; 25 см. - (Методы в биологии). - Библиогр. в конце ст. - ISBN 978-5-9963-0738-8. (2 экз.).
- Нуклеиновые кислоты. От А до Я [Текст] : научное издание / Б. Аппель [и др.] ; ред. С. Мюллер ; пер. с англ.: А. А. Синюшина, Ю. В. Киселёвой. - М. : Бином. Лаборатория знаний, 2013. - 413 с. : ил., [4] вкл. л. ил. ; 24 см. - Библиогр.: с. 409-412. - Пер. изд. : Nucleic acids from A to Z : A Concise Encyclopedia. - 2008. - ISBN 978-5-9963-0376-2. (1 экз.).
- Основы лабораторной работы с нуклеиновыми кислотами [Текст] : учеб. пособие / Н. И. Рекославская, Р. К. Саляев ; рец.: В. П. Саловарова, Л. А. Ломоватская ; Иркут. гос. ун-т, СО РАН, Иркут. науч. центр, Сиб. ин-т физиологии и биохимии растений. - Иркутск : Изд-во ИГУ, 2012. - 186 с. : ил. ; 21 см. - Библиогр.: с. 184-186. - ISBN 978-5-9624-0642-8. (43 экз.).
- Молекулярная биология акариот [Текст] : учеб. пособие / В. П. Саловарова, Г. В. Юринова. - Иркутск : Перекресток, 2012. - 251 с. : цв. ил. ; 20 см. - ISBN 978-5-903757-10-7. (59 экз.).
- Молекулярная биология [Текст] : рибосомы и биосинтез белка : учеб. для студ. вузов, обуч. по напр. "Биология" и биол. спец. / А. С. Спирин. - М. : Академия, 2011. - 496 с. : [16] вкл. л. цв. ил., ил. ; 24 см. - (Высшее профессиональное образование). - Библиогр. в конце глав. - ISBN 978-5-7695-6668-4. (3 экз.).
- Принципы и методы биохимии и молекулярной биологии [Электронный ресурс] —2-е изд. (эл.). [Электронный ресурс] / К. Уилсон, Дж. ред. Уолкер. - Москва : БИНОМ. Лаборатория знаний, 2015. - 855 с. : ил. - Режим доступа: ЭБС "Айбукс". - Неогранич. доступ. - ISBN 978-5-9963-2877-2 : Б. ц.