Б.1.В.ОД.2 Молекулярная биология

Вопросы для подготовки к зачету по дисциплине

Б.1.В.ОД.2 Молекулярная биология

 

  1. Строение и функции нуклеиновых кислот. Молекула первожизни – РНК.
  2. Полимеразная цепная реакция (ПЦР): компоненты, схема.
  3. Виды ПЦР: протяженная, мультиплексная, ОТ-ПЦР, ПЦР в режиме реального времени, ПЦР-ПДРФ. Недостатки метода. Применение.
  4. Секвенирование ДНК с помощью метода А. Максама – У. Гилберта.
  5. Дидезоксинуклеотидный метод Ф. Сэнгера. Определение нуклеотидной последовательности РНК.
  6. Геномы клеточных органелл: хлоропласты и митохондрии.
  7. Биоинформатика. Геномика и метаболономика (базы данных, геном человека, перспективы).
  8. Репликация ДНК. Топологические перестройки в ДНК. Использование ингибиторов топоизомераз в медицине.
  9. Проблема недорепликации концевых районов хромосом. Структура и функции теломер. Удлинение теломер с помощью теломеразы. Длина теломерной ДНК и активность теломеразы в клетках человека.
  10. Теломеразы: структура и механизм действия. Альтернативные механизмы удлинения теломер. Теломерная теория старения. Роль теломеразы в онкогенезе.
  11. Система рестрикции – модификации у бактерий: открытие, R-M-системы I, II и III типов. Эндонуклеаза EcoRI. Применение. Функции R-M-системы.
  12. Метилирование ДНК эукариот.
  13. Репарация ДНК.
  14. Регуляция транскрипции в промоторах и терминаторах у прокариот. lac-оперон – пример негативной регуляции. Trp-оперон – пример позитивной регуляции.
  15. Регуляция транскрипции у эукариот. Транскрипционные факторы. Роль структуры хроматина в транскрипции. Альтернативный сплайсинг.
  16. Уровни организации белковой молекулы. Факторы, определяющие пространственную структуру белка. Постулат Анфинсена. Парадокс Левинталя.
  17. Модели сворачивания белков. Модель промежуточных состояний. Сворачивание по принципу «все или ничего».
  18. Механизмы регуляции фолдинга. регуляция скорости превращения «расплавленной глобулы» в нативную структуру; защита частично свернутого белка от неспецифической агрегации. Фолдазы и шапероны. Нарушения фолдинга белков.
  19. Сортировка белков в клетке. Синтез на мембраносвязанных и свободных рибосомах. Механизмы транспорта белков через мембраны.
  20. Общие принципы импорта белков в органеллы. Роль транспортеров и шаперонов в транслокации белков через мембрану. Образование коротких пептидов.
  21. Процессы в гранулярной эпс. Этапы гликозилирования. Особенности предшественников митохондриальных и хлоропластных белков.
  22. Процессы в комплексе Гольджи. Сортировка белков. Заболевания, связанные с нарушением сигналов внутриклеточного транспорта. Сортировка и транспорт белков митохондрий и ядер.
  23. Роль катаболизма в обновлении белков в клетке. Стадии деградации белков. Протеолитические ферменты. Лизосомы.
  24. Механизм действия и функции убиквитина. Структура протеосомы.
  25. Комплексы циклинзависимых киназ. "Сверочные точки" клеточного цикла. Механизм остановки цикла и перехода к апоптозу. Белок р53: функциональная роль, структура, обмен.
  26. "Апоптоз изнутри". "Апоптоз по команде". Морфология апоптоза и некроза.
  27. Факторы апоптоза. Апоптоз в растительных клетках. Патологические состояния, связанные с активацией или угнетением апоптоза. Онкогенез. Протоонкогены и опухолевые супрессоры.

 

 

Рекомендуемая литература по дисциплине

Б.1.В.ОД.2 Молекулярная биология

а) основная литература

  1. Биохимия [Текст] : учебник / В. П. Комов, В. Н. Шведова. - 3-е изд., стер. - М. : Дрофа, 2008. - 639 с. ; 24 см. - (Высшее образование: Современный учебник). - Предм. указ.: с. 620-630. - ISBN 978-5-358-04872-0. (50 экз.).
  2. Биохимия [Электронный ресурс] : учеб. для академ. бакалавриата : для студ. вузов, обуч. по направл. 655500 "Биотехнология" / В. П. Комов. - 4-е изд., испр. и доп. - ЭВК. - М. : Юрайт, 2014. - 640 с. - (Бакалавр. Академический курс). - Режим доступа: ЭЧЗ "Библиотех". - Неогранич. доступ. - ISBN 978-5-9916-3929-3.
  3. Молекулярная биология: биосинтез и функционирование макромолекул у прокариот [Текст] : учеб. пособие / В. И. Чемерилова, О. А. Секерина ; рец.: Б. Н. Огарков, С. Н. Жданова ; Иркутский гос. ун-т. - Иркутск : Изд-во ИГУ, 2013. - 314 с. : ил. ; 20 см. - ISBN 978-5-9624-0928-3. (59 экз.).
  4. Молекулярная биология: биосинтез и функционирование макромолекул у прокариот [Электронный ресурс] : учеб. пособие / В. И. Чемерилова. - ЭВК. - Иркутск : Изд-во ИГУ, 2013. - Режим доступа: ЭЧЗ "Библиотех". - Неогранич. доступ. - ISBN 978-5-9624-0928-3.

 

б) дополнительная литература

  1. Молекулярно-генетические и биохимические методы в современной биологии растений [Текст] : научное издание / ред.: Вл. В. Кузнецов, В. В. Кузнецов, Г. А. Романов. - М. : Бином. Лаборатория знаний, 2012. - 487 с. : ил. ; 25 см. - (Методы в биологии). - Библиогр. в конце ст. - ISBN 978-5-9963-0738-8. (2 экз.).
  2. Нуклеиновые кислоты. От А до Я [Текст] : научное издание / Б. Аппель [и др.] ; ред. С. Мюллер ; пер. с англ.: А. А. Синюшина, Ю. В. Киселёвой. - М. : Бином. Лаборатория знаний, 2013. - 413 с. : ил., [4] вкл. л. ил. ; 24 см. - Библиогр.: с. 409-412. - Пер. изд. : Nucleic acids from A to Z : A Concise Encyclopedia. - 2008. - ISBN 978-5-9963-0376-2. (1 экз.).
  3. Основы лабораторной работы с нуклеиновыми кислотами [Текст] : учеб. пособие / Н. И. Рекославская, Р. К. Саляев ; рец.: В. П. Саловарова, Л. А. Ломоватская ; Иркут. гос. ун-т, СО РАН, Иркут. науч. центр, Сиб. ин-т физиологии и биохимии растений. - Иркутск : Изд-во ИГУ, 2012. - 186 с. : ил. ; 21 см. - Библиогр.: с. 184-186. - ISBN 978-5-9624-0642-8. (43 экз.).
  4. Молекулярная биология акариот [Текст] : учеб. пособие / В. П. Саловарова, Г. В. Юринова. - Иркутск : Перекресток, 2012. - 251 с. : цв. ил. ; 20 см. - ISBN 978-5-903757-10-7. (59 экз.).
  5. Молекулярная биология [Текст] : рибосомы и биосинтез белка : учеб. для студ. вузов, обуч. по напр. "Биология" и биол. спец. / А. С. Спирин. - М. : Академия, 2011. - 496 с. : [16] вкл. л. цв. ил., ил. ; 24 см. - (Высшее профессиональное образование). - Библиогр. в конце глав. - ISBN 978-5-7695-6668-4. (3 экз.).
  6. Принципы и методы биохимии и молекулярной биологии [Электронный ресурс] —2-е изд. (эл.). [Электронный ресурс] / К. Уилсон, Дж. ред. Уолкер. - Москва : БИНОМ. Лаборатория знаний, 2015. - 855 с. : ил. - Режим доступа: ЭБС "Айбукс". - Неогранич. доступ. - ISBN 978-5-9963-2877-2 : Б. ц.