Протопопова Марина Владимировна

Кандидат биологических наук, доцент

Образование и ученая степень:

Кандидат биологических наук, тема диссертации "Механизмы неспецифической резистентности у байкальских и палеарктических амфипод в условиях интоксикации хлоридом кадмия", Сибирский федеральный университет, Красноярск, 2011г.
Аспирантура, Иркутский государственный университет, 2010г.
Диплом о высшем образовании с отличием, Иркутский государственный университет, 2007г.

Научные интересы:

Филогеография и филогенетика растений
Молекулярная идентификация растений (ДНК-штрихкодирование)
Генетическая инженерия растений
Сохранение биологического разнообразия
Неморальные реликты

Читаемые курсы:

Молекулярная биология клетки (бакалавриат)
Актуальные вопросы генетики (бакалавриат)
Большой практикум по профилю «Физико-химическая биология и биотехнология» (бакалавриат)
Регулируемая гибель клеток (магистратура)
Регуляция внутриклеточных процессов (магистратура)

Участие в грантах:

Грант Президентского фонда природы: «Изучение пространственно-генетической структуры редких реликтовых видов растений гор Южной Сибири с целью сохранения их генофонда», руководитель (2026-2027);
Грант РНФ: «Филогеографическая структура позднекайнозойских реликтов Южной Сибири и их близкородственных видов с различной широтой голарктического распространения как отражение глобальных климатических изменений», руководитель (2023–2024);
Грант РНФ: «Оценка последствий климатических изменений и техногенных воздействий на реликтовые виды растений и биоценозы Сибири и Дальнего Востока с использованием современных молекулярно-генетических подходов», руководитель (2017–2019);
Грант РФФИ: «Оценка генетического полиморфизма неморальных реликтовых растений Южной Сибири на примере Anemone baicalensis (Ranunculaceae) и Waldsteinia ternata (Rosaceae)», руководитель (2014–2015);
Проект ФЦП: «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России»: «Изучение возможности и особенностей применения универсальных молекулярно-биохимических стресс-маркеров для оценки неблагоприятных воздействий на экосистему оз. Байкал», руководитель (2009–2010);
Грант РНФ: «Роль протекторных белков дегидринов в формировании устойчивости к засухе, холоду и тяжелым металлам у трансгенных растений тополя», исполнитель (2024–2025);
Грант РНФ: «Молекулярные, биохимические, физиологические и морфологические особенности генетически модифицированного быстрорастущего тополя берлинского», исполнитель (2022–2023);
Грант РФФИ: «Структура и пространственная организация растительного покрова неморального рефугима на северном макросклоне хребта Хамар-Дабан (Восточная Сибирь)», исполнитель (2016–2018);
Грант РФФИ № 14-04-3168: «Надмолекулярная организация и реорганизация дыхательной цепи митохондрий растений в условиях холодовой адаптации и низкотемпературного стресса», исполнитель (2014–2016);
Грант РФФИ: «Изучение влияния гиперэкспрессии ключевых генов биосинтеза гиббереллинов на морфогенез и биомассу древесных растений», исполнитель (2014–2015).

Протопопова-фото-2026

Научно-педагогический стаж - 18 лет

Контакты:
Телефон: 8 (3952)24-18-70
Электронная почта: marina.v.protopopova@gmail.com

Адрес: 664003, г. Иркутск, ул. Сухэ-Батора, 5.
Иркутский государственный университет,
Кафедра физико-химической биологии, биоинженерии и бионформатики.

Список публикаций:

Protopopova M., Pavlichenko V. A rapid total protein extraction protocol for SDS-PAGE-based proteomic analysis of woody plants cultured in vitro: a case study of Berlin poplar // E3S Web of Conferences. 2026. Vol. 703. Art. 01011. P. 1–9. https://doi.org/10.1051/e3sconf/202670301011
Pavlichenko V., Protopopova M. Evaluation of salinity tolerance in two transgenic poplar lines harboring TaWCS120 and HvDHN5 genes // E3S Web of Conferences. 2026. Vol. 703. Art. 01014. P. 1–7. https://doi.org/10.1051/e3sconf/202670301014
Protopopova M., Nelyubina P., Pavlichenko V. Current Phylogeographic Structure of Anemone altaica (Ranunculaceae) on the Khamar-Daban Ridge Reflects Quaternary Climate Change in Baikal Siberia // Quaternary. 2025. Vol. 8, No. 2. Art. 20. P. 1–25. https://doi.org/10.3390/quat8020020
Krivenko D.A., Barsukova I.N., Chepinoga V.V. Gnutikov A.A., Gudkova P.D., Leonova T.V., Myakoshina Y.A., Olonova M.V., Pavlichenko V.V., Protopopova M.V. Botanica Pacifica plant chromosome data 4 // Botanica Pacifica. 2025. Vol. 14, No. 1. P. 187–194. https://doi.org/10.17581/bp.2025.14101
Pavlichenko V.V., Protopopova M.V. Kanamycin-induced growth suppression of fast-growing transgenic poplar carrying the nptII gene // BIO Web of Conferences. 2025. Vol. 160. Art. 02035. P. 1–7. https://doi.org/10.1051/bioconf/202516002035
Pavlichenko V.V., Protopopova M.V. Simplified Method for Agrobacterium-Mediated Genetic Transformation of Populus x berolinensis K. Koch // Methods and Protocols. 2024. Vol. 7, No. 1. Art. 12. P. 1–13. https://doi.org/10.3390/mps7010012
Гамова Н.С., Протопопова М.В., Павличенко В.В., Коротков Ю.Н. Первая достоверная находка Galium odoratum (L.) Scop. и новые местонахождения Galium paradoxum Maxim. в республике Бурятия // Труды Карельского научного центра РАН. 2024. № 1. С. 114–123. https://doi.org/10.17076/bg1850
Павличенко В.В., Протопопова М.В. Получение и первичная оценка фенотипа тополя берлинского, трансформированного геном AtGA20ox1 // Физиология растений. 2024. Т. 71, № 2. С. 228–242. https://doi.org/10.31857/S0015330324020092
Pavlichenko V.V., Protopopova M.V. Selection of the optimal concentration of indole-3-butyric acid (IBA) in the nutrient medium for effective micropropagation of Populus berolinensis // E3S Web of Conferences. 2023. Vol. 463. Art. 01032. P. 1–6. https://doi.org/10.1051/e3sconf/202346301032
Protopopova M., Pavlichenko V., Chepinoga V., Gnutikov A., Adelshin R. Waldsteinia within Geum s.l. (Rosaceae): Main Aspects of Phylogeny and Speciation History // Diversity. 2023. Vol. 15, No. 4. Art. 479. P. 1–30. https://doi.org/10.3390/d15040479
Protopopova M., Sandanov D., Pavlichenko V., Selyutina I., Stepanov N. The Curious Case of Fritillaria sonnikovae (Liliaceae) in South Siberia: New Insights into Its Origin and Phylogeny // Diversity. 2023. Vol. 15, No. 2. Art. 193. P. 1–21. https://doi.org/10.3390/d15020193
Protopopova M., Pavlichenko V. Eranthis Salisb. (Ranunculaceae) in South Siberia: insights into phylogeography and taxonomy // Diversity. 2022. Vol. 14, No. 10. Art. 779. P. 1-19. https://doi.org/10.3390/d14100779.
Protopopova M.V., Shvetsova N.A., Pavlichenko V.V. The perspectives for DNA barcoding of Rhaponticum carthamoides (Willd.) Iljin using rbcL gene sequence // IOP Conference Series: Earth and Environmental Science. 2021. Vol. 908. Art. 012030. P. 1–7. https://doi.org/10.1088/1755-1315/908/1/012030
Protopopova M.V., Pavlichenko V.V., Stepanov N.V. Phylogeographical patterns based on trnH-psbA plastid DNA shed light on evolution within Waldsteinia (Rosaceae) // IOP Conference Series: Earth and Environmental Science. 2021. Vol. 908. Art. 012027. P. 1–8. https://doi.org/10.1088/1755-1315/908/1/012027
Pavlichenko V.V., Protopopova M.V. Kanamycin application features for the selective screening of genetically modified Populus x berolinensis // IOP Conference Series: Earth and Environmental Science. 2021. Vol. 839. Art. 042020. https://doi.org/10.1088/1755-1315/839/4/042020
Chepinoga V.V., Protopopova M.V., Pavlichenko V.V., Dudov S.V. Habitat Distribution Patterns of Nemoral Relict Plant Species on the Khamar-Daban Ridge (the South of Eastern Siberia) According to Grid Mapping Data // Russian Journal of Ecology. 2021. Vol. 52. P. 212–222. https://doi.org/10.1134/S106741362103005X
Gnutikov A.A., Protopopova M.V., Pavlichenko V.V., Stepanov N.V., Chepinoga V.V. IAPT chromosome data 32/8 // Taxon. 2020. Vol. 69, No. 5. P. 1130, E13–E14. https://doi.org/10.1002/tax.12322
Pavlichenko V.V., Protopopova M.V., Voinikov V.K. A comparative study of the various light sources regenerative potential using Populus berolinensis root explants as an example // IOP Conference Series: Earth and Environmental Science. 2020. Vol. 548. Art. 062093. https://doi.org/10.1088/1755-1315/548/6/062093
Protopopova M.V., Pavlichenko V.V., Luckenbach T. Changes of cellular stress response related hsp70 and abcb1 transcript and Hsp70 protein levels in Siberian freshwater amphipods upon exposure to cadmium chloride in the lethal concentration range // PeerJ. 2020. Vol. 8. Art. e8635. P. 1–24. https://doi.org/10.7717/peerj.8635
Протопопова М.В., Павличенко В.В., Орлова Д.А., Чепинога В.В. Филогеографическая структура Anemone baicalensis (Ranunculaceae) на основе полиморфизма пластидной ДНК (trnL-trnF) как подтверждение существования плейстоценовых микрорефугиумов на хр. Хамар-Дабан // Известия Иркутского государственного университета. Серия «Биология. Экология». 2019. Т. 30. С. 3–15. https://doi.org/10.26516/2073-3372.2019.30.3
Protopopova M., Pavlichenko V., Gnutikov A., Chepinoga V. DNA Barcoding of Waldsteinia Willd. (Rosaceae) Species Based on ITS and trnH-psbA Nucleotide Sequences // Information Technologies in the Research of Biodiversity. Cham: Springer Nature Switzerland, 2019. P. 107–115. https://doi.org/10.1007/978-3-030-11720-7_15
Чепинога В.В., Степанов Н.В., Протопопова М.В., Павличенко В.В. О распространении Вальдштейнии тройчатой (Waldsteinia ternata, Rosaceae) в Западном Саяне // Ботанический журнал. 2019. Т. 104, № 8. С. 1203–1210. https://doi.org/10.1134/S0006813619060048
Gnutikov A.A., Protopopova M.V., Pavlichenko V.V., Chepinoga V.V. IAPT chromosome data 28 // Taxon. 2018. Vol. 67, No. 6. P. 1236–1237, E7–E9. https://doi.org/10.12705/676.39
Чепинога В.В., Степанцова Н.В., Протопопова М.В. и др. Флористические находки на хребте Хамар-Дабан (Южное Прибайкалье, Восточная Сибирь) // Известия Иркутского государственного университета. Серия «Биология. Экология». 2018. Т. 25. С. 41–53. https://doi.org/10.26516/2073-3372.2018.25.41
Павличенко В.В., Протопопова М.В., Войников В.К. Результаты пятилетнего лабораторного культивирования растений тополя берлинского, генетически модифицированных генами uidA и nptII // Известия Иркутского государственного университета. Серия «Биология. Экология». 2018. Т. 25. С. 3–14. https://doi.org/10.26516/2073-3372.2018.25.3
Chepinoga V.V., Protopopova M.V., Pavlichenko V.V. Detection of the Most Probable Pleistocene Microrefugia on the Northern Macroslope of the Khamar-Daban Ridge (Southern Prebaikalia) // Contemporary Problems of Ecology. 2017. Vol. 10, No. 1. P. 38–42. https://link.springer.com/article/10.1134/S1995425517010036
Gnutikov A.A., Protopopova M.V., Chepinoga V.V. et al. IAPT/IOPB chromosome data 26 // Taxon. 2017. Vol. 66, No. 6. P. 1488–1489, E6–E8. https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.12705/666.30
Gnutikov A.A., Protopopova M.V., Pavlichenko V.V., Chepinoga V.V. IAPT/IOPB chromosome data 22 // Taxon. 2016. Vol. 65, No. 5. P. 1201, E7–E8. https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.12705/655.40
Протопопова М.В., Павличенко В.В., Коновалов А.Д. и др. Перспективны использования внутренних транскрибируемых спейсеров (ITS1 и ITS2) для идентификации редких видов растений на примере рода Waldsteinia (Rosaceae) // Известия Иркутского государственного университета. Серия «Биология. Экология». 2016. Т. 17. С. 5–11.
Чепинога В.В., Протопопова М.В., Павличенко В.В., Гладких Е.М. К распространению неморальных видов растений на хребте Хамар-Дабан (Южное Прибайкалье, Восточная Сибирь) // Известия Иркутского государственного университета. Серия «Биология. Экология». 2016. Т. 17. С. 30–37.
Павличенко В.В., Протопопова М.В., Байрамова Э.М. и др. Различная устойчивость к канамицину трансгенных клонов Populus ×berolinensis экспрессирующих ген NptII // Известия Иркутского государственного университета. Серия «Биология. Экология». 2016. Т. 18. С. 3–12.
Павличенко В.В., Протопопова М.В., Золотовская Е.Д. и др. Изучение влияния различных цитокининов на эффективность образования регенерантов при микроклональном размножении тополя берлинского (Populus berolinensis Dipp.) // Известия вузов. Прикладная химия и биотехнология. 2016. Т. 6, № 4. С. 164–168.
Протопопова М.В., Павличенко В.В., Люкенбах Т. Может ли повышенное содержания растворенных гуминовых веществ в водоемах ограничивать распространение эндемичных видов за пределы озера Байкал? // Известия Иркутского государственного университета. Серия «Биология. Экология». 2016. Т. 15. С. 89–93.
Павличенко В.В., Протопопова М.В., Люкенбах Т. Использование RACE ПЦР для получения частичной последовательности, кодирующей Abcb-подобный белок у Gammarus lacustris (Sars, 1863) // Известия Иркутского государственного университета. Серия «Биология. Экология». 2016. Т. 16. С. 90–93.
Pavlichenko V.V., Protopopova M.V., Timofeyev M.A., Luckenbach T. Identification of a putatively multixenobiotic resistance related Abcb1 transporter in amphipod species endemic to the highly pristine Lake Baikal // Environmental Science and Pollution Research. 2015. Vol. 22, No. 7. P. 5453–5468. https://link.springer.com/article/10.1007/s11356-014-3758-y
Чепинога В.В., Мишина А.В., Протопопова М.В. и др. Новые данные о распространении некоторых неморальных реликтовых растений в предгорьях хребта Хамар-Дабан (Южное Прибайкалье) // Ботанический журнал. 2015. Т. 100, № 5. С. 478–489. https://www.elibrary.ru/item.asp?id=23411881
Протопопова М.В., Павличенко В.В., Гнутиков А.А. и др. Использование генетических маркеров для оценки состояния реликтовых видов растений Байкальской Сибири // Вестник РУДН. Серия: Экология и безопасность жизнедеятельности. 2015. № 4. С. 28–36.
Protopopova M.V., Pavlichenko V.V., Menzel R. et al. Contrasting cellular stress responses of Baikalian and Palearctic amphipods upon exposure to humic substances: environmental implications // Environmental Science and Pollution Research. 2014. Vol. 21, No. 24. P. 14124–14137. https://link.springer.com/article/10.1007/s11356-014-3323-8
Bedulina D.S., Evgen’ev M.B., Timofeyev M.A. et al. Expression patterns and organization of the hsp70 genes correlate with thermotolerance in two congener endemic amphipod species (Eulimnogammarus cyaneus and E. verrucosus) from Lake Baikal // Molecular Ecology. 2013. Vol. 22, No. 5. P. 1416–1430.
Shatilina Z.M., Riss H.W., Protopopova M.V. et al. The role of the heat shock proteins (HSP70 and sHSP) in the thermotolerance of freshwater amphipods from contrasting habitats // Journal of Thermal Biology. 2011. Vol. 36, No. 2. P. 142–149.
Protopopova M.V., Takhteev V.V., Shatilina Zh.M. et al. Small HSPs molecular weights as new indication to the hypothesis of segregated status of thermophilic relict Gmelinoides fasciatus among Baikal and Palearctic amphipods // Journal of Stress Physiology & Biochemistry. 2011. Vol. 7, No. 2. P. 175–182.
Shatilina Zh.M., Pobezhimova T.P., Grabel’nykh O.I. et al. Heat shock proteins in the mechanisms of stress adaptation in Baikal amphipods and Palearctic Gammarus lacustris Sars. I. HSP70 family // Contemporary Problems of Ecology. 2010. Vol. 3, No. 1. P. 41–49.
Shatilina Zh.M., Bedulina D.S., Protopopova M.V. et al. Heat shock proteins in the mechanisms of stress adaptation in Baikal amphipods and Palaearctic Gammarus lacustris Sars II. Small HSP family // Contemporary Problems of Ecology. 2010. Vol. 3, No. 4. P. 449–456.
Shatilina Zh.M., Gubanov M.V., Zadereev E.S. et al. Comparative study of thermoresistances’ cellular mechanisms in representatives of the Gammarus lacustris Sars populations inhabiting Saline Lake Shira (Republic of Khakassia) and a fresh water body in the Cis-Baikal region // Doklady Biological Sciences. 2010. Vol. 434, No. 1. P. 359–362.
Timofeyev M.A., Protopopova M., Pavlichenko V., Steinberg C.E.W. Can acclimation of amphipods change their antioxidative response? // Aquatic Ecology. 2009. Vol. 43, No. 4. P. 1041–1045.
Timofeyev M.A., Shatilina Zh.M., Protopopova M.V. et al. Thermal stress defense in freshwater amphipods from contrasting habitats with emphasis on small heat shock proteins (sHSPs) // Journal of Thermal Biology. 2009. Vol. 34, No. 6. P. 281–285.
Timofeyev M., Shatilina Zh., Bedulina D. et al. Evaluation of biochemical responses in Palearctic and Lake Baikal endemic amphipod species exposed to CdCl₂ // Ecotoxicology and Environmental Safety. 2008. Vol. 70, No. 1. P. 99–105.
Timofeyev M.A., Shatilina Zh.M., Bedulina D.S. et al. Application of heat shock proteins as stress markers in aquatic organisms using endemic Baikal amphipods as an example // Applied Biochemistry and Microbiology. 2008. Vol. 44, No. 3. P. 310–313.
Колесниченко А.В., Тимофеев М.А., Протопопова М.В. Токсичность наноматериалов — 15 лет исследований // Российские нанотехнологии. 2008. Т. 3, № 3-4. С. 54–61.
Шатилина Ж.М., Бедулина Д.С., Протопопова М.В. Участие низкомолекулярных БТШ в механизмах клеточной защиты, активизирующихся при интоксикации солями кадмия // Вестник Российского государственного медицинского университета. 2005. № 3 (42). С. 195.