Павличенко Василий Валерьевич

Список публикаций:

1. Protopopova M., Pavlichenko V. A rapid total protein extraction protocol for SDS-PAGE-based proteomic analysis of woody plants cultured in vitro: a case study of Berlin poplar // E3S Web of Conferences. 2026. Vol. 703. Art. 01011. P. 1–9. https://doi.org/10.1051/e3sconf/202670301011
2. Pavlichenko V., Protopopova M. Evaluation of salinity tolerance in two transgenic poplar lines harboring TaWCS120 and HvDHN5 genes // E3S Web of Conferences. 2026. Vol. 703. Art. 01014. P. 1–7. https://doi.org/10.1051/e3sconf/202670301014
3. Protopopova M., Nelyubina P., Pavlichenko V. Current Phylogeographic Structure of Anemone altaica (Ranunculaceae) on the Khamar-Daban Ridge Reflects Quaternary Climate Change in Baikal Siberia // Quaternary. 2025. Vol. 8, No. 2. Art. 20. P. 1–25. https://doi.org/10.3390/quat8020020
4. Krivenko D.A., Barsukova I.N., Chepinoga V.V. Gnutikov A.A., Gudkova P.D., Leonova T.V., Myakoshina Y.A., Olonova M.V., Pavlichenko V.V., Protopopova M.V. Botanica Pacifica plant chromosome data 4 // Botanica Pacifica. 2025. Vol. 14, No. 1. P. 187–194. https://doi.org/10.17581/bp.2025.14101
5. Pavlichenko V.V., Protopopova M.V. Kanamycin-induced growth suppression of fast-growing transgenic poplar carrying the nptII gene // BIO Web of Conferences. 2025. Vol. 160. Art. 02035. P. 1–7. https://doi.org/10.1051/bioconf/202516002035
6. Pavlichenko V.V., Protopopova M.V. Simplified Method for Agrobacterium-Mediated Genetic Transformation of Populus x berolinensis K. Koch // Methods and protocols. – 2024. – V.7(1):12. – P. 1-13. https://doi.org/10.3390/mps7010012
7. Гамова Н.С., Протопопова М.В., Павличенко В.В., Коротков Ю.Н. Первая достоверная находка Galium odoratum (L.) Scop. и новые местонахождения Galium paradoxum Maxim. в республике Бурятия // Труды Карельского научного центра РАН. 2024. No 1. С. 114-123. https://doi.org/10.17076/bg1850.
8. Павличенко В.В., Протопопова М.В. Получение и первичная оценка фенотипа тополя берлинского, трансформированного геном AtGA20ox1 // Физиология растений. 2024. Т. 71, № 2. С. 228–242. https://doi.org/10.31857/S0015330324020092
9. Pavlichenko V.V., Protopopova M.V. Selection of the optimal concentration of indole-3-butyric acid (IBA) in the nutrient medium for effective micropropagation of Populus berolinensis // E3S Web of Conferences. 2023. – V. 463, 01032. – P. 1-6. https://doi.org/10.1051/e3sconf/202346301032
10. Protopopova M., Pavlichenko V., Chepinoga V., Gnutikov A., Adelshin R. 2023. Waldsteinia within Geum s.l. (Rosaceae): Main Aspects of Phylogeny and Speciation History. Diversity 2023, 15(4), 479: 1–30. https://doi.org/10.3390/d15040479
11. Protopopova M., Sandanov D., Pavlichenko V., Selyutina I., Stepanov N. 2023. The Curious Case of Fritillaria sonnikovae (Liliaceae) in South Siberia: New Insights into Its Origin and Phylogeny. Diversity 15 (2), 193: 1-21. https://doi.org/10.3390/d15020193
12. Protopopova M., Pavlichenko V. Eranthis Salisb. (Ranunculaceae) in South Siberia: Insights into Phylogeography and Taxonomy // Diversity. – 2022. – V. 14(10), 779. – P. 1-19.
13. Protopopova M.V., Shvetsova N.A., Pavlichenko V.V. The perspectives for DNA barcoding of Rhaponticum carthamoides (Willd.) Iljin using rbcL gene sequence // IOP Conference Series: Earth and Environmental Science. 2021. Vol. 908. Art. 012030. P. 1–7. https://doi.org/10.1088/1755-1315/908/1/012030
14. Protopopova M.V., Pavlichenko V.V., Stepanov N.V. Phylogeographical patterns based on trnH-psbA plastid DNA shed light on evolution within Waldsteinia (Rosaceae) // IOP Conference Series: Earth and Environmental Science. 2021. Vol. 908. Art. 012027. P. 1–8. https://doi.org/10.1088/1755-1315/908/1/012027
15. Pavlichenko V.V., Protopopova M.V. Kanamycin application features for the selective screening of genetically modified Populus x berolinensis // IOP Conference Series: Earth and Environmental Science. 2021. Vol. 839. Art. 042020. https://doi.org/10.1088/1755-1315/839/4/042020
16. Chepinoga V.V., Protopopova M.V., Pavlichenko V.V., Dudov S.V. Habitat Distribution Patterns of Nemoral Relict Plant Species on the Khamar-Daban Ridge (the South of Eastern Siberia) According to Grid Mapping Data // Russian Journal of Ecology. 2021. Vol. 52. P. 212–222. https://doi.org/10.1134/S106741362103005X
17. Gnutikov A.A., Protopopova M.V., Pavlichenko V.V., Stepanov N.V., Chepinoga V.V. IAPT chromosome data 32/8 // Taxon. 2020. Vol. 69, No. 5. P. 1130, E13–E14. https://doi.org/10.1002/tax.12322
18. Protopopova M.V., Pavlichenko V.V., Luckenbach T. (2020) Changes of cellular stress response related hsp70 and abcb1 transcript and Hsp70 protein levels in Siberian freshwater amphipods upon exposure to cadmium chloride in the lethal concentration range. PeerJ, 8: e8635.
19. Gnutikov A.A., Protopopova M.V., Pavlichenko V.V., Stepanov N.V., Chepinoga V.V. (2020) IAPT chromosome data 32/8. In: Marhold, K. & Kučera, J. (eds.) & al., IAPT chromosome data 32. Taxon, 69(5): 1130, E13–E14.
20. Pavlichenko V.V., Protopopova M.V., Voinikov V.K. (2020) A comparative study of the various light sources regenerative potential using Populus berolinensis root explants as an example. IOP Conference Series: Earth and Environmental Science, 548: 062093.
21. Protopopova M., Pavlichenko V., Gnutikov A., Chepinoga V. (2019) DNA Barcoding of Waldsteinia Willd. (Rosaceae) Species Based on ITS and trnH-psbA Nucleotide Sequences. In: Bychkov I., Voronin V. (eds) Information Technologies in the Research of Biodiversity. Springer Proceedings in Earth and Environmental Sciences. Cham: Springer Nature Switzerland: 107–115.
22. Протопопова М.В., Павличенко В.В., Орлова Д.А., Чепинога В.В. (2019) Филогеографическая структура Anemone baicalensis (Ranunculaceae) на основе полиморфизма пластидной ДНК (trnL-trnF) подтверждает существование плейстоценовых микрорефугиумов на хр. Хамар-Дабан. Известия Иркутского государственного университета. Серия «Биология. Экология», 30: 3–15.
23. Чепинога В.В., Степанов Н.В., Протопопова М.В., Павличенко В.В. (2019) О распространении Вальдштейнии тройчатой (Waldsteinia ternata, Rosaceae) в Западном Саяне. Ботанический журнал, 104 (8): 1203–1210.
24. Чепинога В.В., Степанцова Н.В., Протопопова М.В., Павличенко В.В., Гладких Е.В., Арбузова Г.А., Скорнякова А.М. Флористические находки на хребте Хамар-Дабан (Южное Прибайкалье, Восточная Сибирь) // Известия Иркутского государственного университета. Серия «Биология. Экология». 2018. Т. 25. С. 41–53. https://doi.org/10.26516/2073-3372.2018.25.41
25. Павличенко В.В., Протопопова М.В., Войников В.К. Результаты пятилетнего лабораторного культивирования растений тополя берлинского, генетически модифицированных генами uidA и nptII // Известия Иркутского государственного университета. Серия «Биология. Экология». 2018. Т. 25. С. 3–14. https://doi.org/10.26516/2073-3372.2018.25.3
26. Chepinoga V.V., Protopopova M.V., Pavlichenko V.V. Detection of the Most Probable Pleistocene Microrefugia on the Northern Macroslope of the Khamar-Daban Ridge (Southern Prebaikalia) // Contemporary Problems of Ecology. 2017. Vol. 10, No. 1. P. 38–42. https://link.springer.com/article/10.1134/S1995425517010036
27. Gnutikov A.A., Protopopova M.V., Chepinoga V.V. et al. IAPT/IOPB chromosome data 26 // Taxon. 2017. Vol. 66, No. 6. P. 1488–1489, E6–E8. https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.12705/666.30
28. Gnutikov A.A., Protopopova M.V., Pavlichenko V.V., Chepinoga V.V. IAPT/IOPB chromosome data 22 // Taxon. 2016. Vol. 65, No. 5. P. 1201, E7–E8. https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.12705/655.40
29. Протопопова М.В., Павличенко В.В., Коновалов А.Д., Золотовская Е.Д., Байрамова Э.М, Чепинога В.В. Перспективны использования внутренних транскрибируемых спейсеров (ITS1 и ITS2) для идентификации редких видов растений на примере рода Waldsteinia (Rosaceae) // Известия Иркутского государственного университета. Серия «Биология. Экология». 2016. Т. 17. С. 5–11.
30. Чепинога В.В., Протопопова М.В., Павличенко В.В., Гладких Е.М. К распространению неморальных видов растений на хребте Хамар-Дабан (Южное Прибайкалье, Восточная Сибирь) // Известия Иркутского государственного университета. Серия «Биология. Экология». 2016. Т. 17. С. 30–37.
31. Павличенко В.В., Протопопова М.В., Байрамова Э.М., Золотовская Е.Д., Коновалов А.Д., Войников В.К. Различная устойчивость к канамицину трансгенных клонов Populus ×berolinensis экспрессирующих ген NptII // Известия Иркутского государственного университета. Серия «Биология. Экология». 2016. Т. 18. С. 3–12.
32. Павличенко В.В., Протопопова М.В., Золотовская Е.Д., Байрамова Э.М., Коновалов А.Д., Войников В.К. Изучение влияния различных цитокининов на эффективность образования регенерантов при микроклональном размножении тополя берлинского (Populus berolinensis Dipp.) // Известия вузов. Прикладная химия и биотехнология. 2016. Т. 6, № 4. С. 164–168.
33. Протопопова М.В., Павличенко В.В., Люкенбах Т. Может ли повышенное содержания растворенных гуминовых веществ в водоемах ограничивать распространение эндемичных видов за пределы озера Байкал? // Известия Иркутского государственного университета. Серия «Биология. Экология». 2016. Т. 15. С. 89–93.
34. Павличенко В.В., Протопопова М.В., Люкенбах Т. Использование RACE ПЦР для получения частичной последовательности, кодирующей Abcb-подобный белок у Gammarus lacustris (Sars, 1863) // Известия Иркутского государственного университета. Серия «Биология. Экология». 2016. Т. 16. С. 90–93.
35. Faria M., Pavlichenko V., Burkhardt-Medicke K., Soares A. M.V.M., Altenburger R., Barata C., Luckenbach T. Use of a combined effect model approach for discriminating between ABCB1- and ABCC1-type efflux activities in native bivalve gill tissue // Toxicology and Applied Pharmacology. 2016. V. 297. P. 56-67.
36. Pavlichenko V.V., Protopopova M.V., Timofeyev M.A., Luckenbach T. Identification of a putatively multixenobiotic resistance related Abcb1 transporter in amphipod species endemic to the highly pristine Lake Baikal // Environmental Science and Pollution Research. 2015. Vol. 22, No. 7. P. 5453–5468. https://link.springer.com/article/10.1007/s11356-014-3758-y
37. Чепинога В.В., Мишина А.В., Протопопова М.В., Павличенко В.В., Быстров С.О., Вилор М.А. Новые данные о распространении некоторых неморальных реликтовых растений в предгорьях хребта Хамар-Дабан (Южное Прибайкалье) // Ботанический журнал. 2015. Т. 100, № 5. С. 478–489. https://www.elibrary.ru/item.asp?id=23411881
38. Протопопова М.В., Павличенко В.В., Гнутиков А.А., Адельшин Р.В., Чепинога В.В. Использование генетических маркеров для оценки состояния реликтовых видов растений Байкальской Сибири // Вестник РУДН. Серия: Экология и безопасность жизнедеятельности. 2015. № 4. С. 28–36.
39. Protopopova M.V., Pavlichenko V.V., Menzel R., Putschew A., Luckenbach T., Steinberg C. E.W. Contrasting cellular stress responses of Baikalian and Palearctic amphipods upon exposure to humic substances: environmental implications // Environmental Science and Pollution Research. 2014. Vol. 21, No. 24. P. 14124–14137. https://link.springer.com/article/10.1007/s11356-014-3323-8
40. Bedulina D.S., Evgen’ev M.B., Timofeyev M.A., Protopopova M.V., Garbuz D.G., Pavlichenko V.V., Luckenbach T., Shatilina Z.M., Axenov-Gribanov D.V., Gurkov A.V., Sokolova I. M. Zatsepina O.G. Expression patterns and organization of the hsp70 genes correlate with thermotolerance in two congener endemic amphipod species (Eulimnogammarus cyaneus and E. verrucosus) from Lake Baikal // Molecular Ecology. 2013. Vol. 22, No. 5. P. 1416–1430.
41. Shatilina Z.M., Riss H.W., Protopopova M.V., Trippe M., Meyer E.I., Pavlichenko V.V., Bedulina D.S., Axenov-Gribanov D.V., Timofeyev M.A. The role of the heat shock proteins (HSP70 and sHSP) in the thermotolerance of freshwater amphipods from contrasting habitats // Journal of Thermal Biology. 2011. Vol. 36, No. 2. P. 142–149.
42. Shatilina Zh.M., Pobezhimova T.P., Grabel’nykh O.I., Bedulina D.S., Protopopova M.V., Pavlichenko V.V., Timofeev M.A. Heat shock proteins in the mechanisms of stress adaptation in Baikal amphipods and Palearctic Gammarus lacustris Sars. I. HSP70 family // Contemporary Problems of Ecology. 2010. Vol. 3, No. 1. P. 41–49.
43. Shatilina Zh.M., Bedulina D.S., Protopopova M.V., Pavlichenko V.V., Pobezhimova T.P., Grabelnykh O.I., Timofeyev M.A. Heat shock proteins in the mechanisms of stress adaptation in Baikal amphipods and Palaearctic Gammarus lacustris Sars II. Small HSP family // Contemporary Problems of Ecology. 2010. Vol. 3, No. 4. P. 449–456.
44. Shatilina Zh.M., Gubanov M.V., Zadereev E.S., Pavlichenko V.V., Axenov-Gribanov D.V., Sapozhnikova E.A., Protopopova M.V., Bedulina D.S., Timofeyev M.A. Comparative study of thermoresistances’ cellular mechanisms in representatives of the Gammarus lacustris Sars populations inhabiting Saline Lake Shira (Republic of Khakassia) and a fresh water body in the Cis-Baikal region // Doklady Biological Sciences. 2010. Vol. 434, No. 1. P. 359–362.
45. Timofeyev M.A., Protopopova M., Pavlichenko V., Steinberg C.E.W. Can acclimation of amphipods change their antioxidative response? // Aquatic Ecology. 2009. Vol. 43, No. 4. P. 1041–1045.
46. Timofeyev M.A., Shatilina Zh.M., Protopopova M.V., Bedulina D.S., Pavlichenko V.V., Kolesnichenko A.V., Steinberg C.E.W.Thermal stress defense in freshwater amphipods from contrasting habitats with emphasis on small heat shock proteins (sHSPs) // Journal of Thermal Biology. 2009. Vol. 34, No. 6. P. 281–285.
47. Timofeyev M., Shatilina Zh., Bedulina D., Protopopova M., Pavlichenko V., Grabelnych O., Kolesnichenko A. Evaluation of biochemical responses in Palearctic and Lake Baikal endemic amphipod species exposed to CdCl₂ // Ecotoxicology and Environmental Safety. 2008. Vol. 70, No. 1. P. 99–105.